Les isoflavonoïdes ont une structure moléculaire similaire à celle des œstrogènes stéroïdiens (hormone sexuelle féminine) et sont donc également appelés phytoestrogènes. Cependant, leur activité hormonale est inférieure d'un facteur 100 à 1,000 par rapport à l'oestrogène formé dans l'organisme mammifère. En raison de leur similitude chimique-structurelle avec le sexe féminin hormones, isoflavones ingéré avec de la nourriture peut se lier au soi-disant récepteur des œstrogènes de type 2 et le bloquer pour les œstrogènes endogènes. Par conséquent, isoflavones chez les femmes ménopausées avec de faibles taux d'œstrogènes endogènes présentent un effet plus œstrogénique, tandis que les isoflavones chez les femmes préménopausées ont un effet anti-œstrogène en bloquant les récepteurs des œstrogènes.
